Fullmetal Alchemist: The Prototype erzählt die Geschichte, wie sie zu beginn der Serie eigentlich geplant war.

Lucy, ein 17-jähriges Mädchen, hat sich vorgenommen eine vollwertige Magierin zu werden. Eines Tages trifft sie bei einem Besuch in Harujion Town Natsu, einen Jungen, der auf jeglichem fahrbaren Gefährt sofort krank wird. Aber Natsu ist kein gewöhnlicher Junge, denn er ist Mitglied der berühmt-berüchtigten Magiergilde "Fairy Tail". Ein spannendes Abenteuer erwartet Lucy, als ihr Schicksal an diesem Tag mit dem von Natsu verknüpft wird.

Kouno Jun ist ein lebensfroher Mensch, der sein Leben mit all seiner Kraft lebt. Im Kindergarten verliebte er sich in das schönste Mädchen seiner Klasse, Hasebe Rino. Er gesteht ihr seine Liebe und Hasebe akzeptiert seine Gefühle, doch in dem Moment, in dem sie antworten will, verschwindet sie. Kouno befragt seine Freunde über Hasebe und findet dabei heraus, dass sich kein einziger von ihnen auch nur an eine Kleinigkeit von ihr erinnert. Sie ist einfach verschwunden, mit allen Erinnerungen über sie, außer denen von Kouno. Während Kouno ein lustloses und verzweifeltes Highschool-Leben führt, taucht Hasebe als Austauschschülerin wieder auf, doch sie scheint nicht dieselbe zu sein, die Kouno aus seiner Kindheit kennt.

Yoh ist die einzige menschliche Person, die in einer merkwürdigen Stadt, irgendwo zwischen dieser Welt und der Welt des Zwielichts, lebt. Die Stadt beherbergt spirituelle Manifestationen in Objekten aus der realen Welt, die alle samt von Männern weggeworfen oder verloren gegangen sind. Yoh ist der Besitzer einer lebensechten Puppe namens Ian, die über eine besondere Fähigkeit verfügt, womit Erinnerungen auf Bildern festgehalten werden können. Mit ihrer Hilfe betreibt er ein Fotogeschäft, das sich „Fuguruma“ nennt und der Mittelpunkt dieses Mangas, in der ein Rückblick auf die Geschichten der Geister geworfen wird, die dieses Geschäft aufsuchen.

Die Geschichte dreht sich um das zweite Jahr von Kazuha Aoi an der West Genetics und Yumi's und Elize's drittes Jahr als Teil der Elite Nummern Einheit.

Freezing: First Chronicle zeigt einen Teil der Geschehnisse, die chronologisch noch vor der ersten Folge der Serie stattgefunden haben und das Leben von Chiffon Fairchild zeigen, die sich gerade in die Akademie von Genetics einlebt.

Ein Crossover zwischen Fairy Tail und Yankee-kun zu Megane-chan (Flunk Punk Rumble).

Lucy, ein 17-jähriges Mädchen, hat sich vorgenommen eine vollwertige Magierin zu werden. Eines Tages trifft sie bei einem Besuch in Harujion Town Natsu, einen Jungen, der auf jeglichem fahrbaren Gefährt sofort krank wird. Aber Natsu ist kein gewöhnlicher Junge, denn er ist Mitglied der berühmt-berüchtigten Magiergilde "Fairy Tail". Ein spannendes Abenteuer erwartet Lucy, als ihr Schicksal an diesem Tag mit dem von Natsu verknüpft wird.

Eine Nebengeschichte zu Fairy Tail über die vier weiblichen Mitglieder von Fairy Tail - Erza, Lucy, Juvia und Wendy!

Natsume sucht Schutz vor dem Regen. Dies tut auch ihre alte Klassenkammeradin Iwasa, die offenbar eine gewisse Abneigung gegen Natsume hegt.

Im Manga Fairy Tail: Blue Mistral (von Rui Watanabe) muss sich Wendy, ein 12-jähriges Mädchen, den Geheimnissen im Drachendorf mithilfe ihrer magischen Kräfte und ihrer entdeckten Liebe stellen.